Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVILO95425 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVILO95425 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVILO95425 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms