Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAPBO95292 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAPBO95292 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAPBO95292 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAPBO95292 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPBO95292 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPBO95292 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPBO95292 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPBO95292 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPBO95292 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPBO95292 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPBO95292 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAPBO95292 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms