Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms