Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNSO60931 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTNSO60931 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms