Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SELENOFO60613 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms