Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO3O43524 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms