Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA2O43364 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms