Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H7C417 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H7C417 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H7C417 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms