Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms