Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DGG1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DGG1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DGG1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DGG1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms