Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSDA5PKW4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSDA5PKW4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms