Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMED7Q9Y3B3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms