Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UTP11Q9Y3A2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms