Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms