Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms