Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1L1Q9UHC9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms