Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT172Q9UG01 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT172Q9UG01 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms