Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DBF4Q9UBU7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DBF4Q9UBU7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms