Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms