Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPG2Q9UBF2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPG2Q9UBF2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms