Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRP2BPQ9P2M1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRP2BPQ9P2M1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms