Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRBP1Q9P2E9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRBP1Q9P2E9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms