Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VNN3Q9NY84 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VNN3Q9NY84 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms