Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHST12Q9NRB3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms