Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC52A3Q9NQ40 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms