Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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