Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms