Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLIRPQ9GZT3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms