Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDGFDQ9GZP0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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