Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms