Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms