Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CIPCQ9C0C6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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