Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM55Q9BYV6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms