Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms