Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms