Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF13CQ96RJ3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms