Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms