Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHDQ96IW2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHDQ96IW2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms