Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BORCS6Q96GS4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms