Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms