Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PLCG1-216ENST00000608885 865 ntTSL 58.18□□□□□ -1.11e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCBP2-209ENST00000463783 4161 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NGLY1-203ENST00000308710 2086 ntTSL 1 (best)8.15□□□□□ -1.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSPAN7-208ENST00000494037 575 ntTSL 48.05□□□□□ -1.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-213ENST00000611963 739 ntTSL 58.04□□□□□ -1.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HIF1AN-202ENST00000478787 888 ntTSL 38.04□□□□□ -1.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EFL1-204ENST00000557939 417 ntTSL 58.02□□□□□ -1.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NT5C2-213ENST00000487810 669 ntTSL 38□□□□□ -1.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-224ENST00000621573 992 ntTSL 37.97□□□□□ -1.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC106869.1-205ENST00000413185 1046 ntTSL 47.97□□□□□ -1.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.147e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.157e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RYK-201ENST00000460933 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.167e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.167e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MPDZ-213ENST00000539508 6574 ntTSL 57.75□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DCTN5-203ENST00000563614 3405 nt7.74□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SLC35E1-201ENST00000409648 3691 ntTSL 27.69□□□□□ -1.187e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NAT10-203ENST00000529523 561 ntTSL 47.66□□□□□ -1.187e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-218ENST00000530064 625 ntTSL 57.62□□□□□ -1.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-209ENST00000442614 869 ntTSL 27.58□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 27.58□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-213ENST00000438761 887 ntTSL 57.57□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AP002360.1-201ENST00000531207 4228 ntTSL 27.53□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PLCB1-217ENST00000628900 560 ntTSL 47.48□□□□□ -1.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKRD28-204ENST00000451422 2485 ntTSL 27.44□□□□□ -1.227e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HEATR3-204ENST00000564942 801 ntTSL 57.39□□□□□ -1.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D31-212ENST00000521980 2552 ntTSL 27.38□□□□□ -1.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BNIP2-208ENST00000478981 1415 ntTSL 37.37□□□□□ -1.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBFOX2-206ENST00000408983 663 ntTSL 37.36□□□□□ -1.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TTC3-218ENST00000484047 1945 ntTSL 27.36□□□□□ -1.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PLCXD2-203ENST00000474484 434 ntTSL 27.31□□□□□ -1.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LGALS8-215ENST00000481485 799 ntTSL 57.22□□□□□ -1.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TTLL4-206ENST00000424644 588 ntTSL 47.17□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCMAP-202ENST00000486262 4063 ntTSL 37.13□□□□□ -1.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-216ENST00000614494 515 ntTSL 57.07□□□□□ -1.287e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 COPA-207ENST00000545284 879 ntTSL 27.05□□□□□ -1.283e-9■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPP1R10-205ENST00000476704 559 ntTSL 37□□□□□ -1.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDAP1-203ENST00000488214 274 ntTSL 36.91□□□□□ -1.31e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.37e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-204ENST00000464399 358 ntTSL 56.88□□□□□ -1.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSPAN7-203ENST00000419600 1683 ntTSL 26.86□□□□□ -1.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-215ENST00000498064 451 ntTSL 26.85□□□□□ -1.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-217ENST00000449647 678 ntTSL 56.84□□□□□ -1.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 56.79□□□□□ -1.327e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.327e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.327e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATM-206ENST00000525056 657 ntTSL 36.77□□□□□ -1.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SMG1-217ENST00000569764 4187 ntTSL 56.68□□□□□ -1.347e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D31-213ENST00000522276 879 ntTSL 36.67□□□□□ -1.347e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AK2-205ENST00000469238 423 ntTSL 26.66□□□□□ -1.347e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NGLY1-201ENST00000280699 1897 ntTSL 56.64□□□□□ -1.357e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-234ENST00000592097 582 ntTSL 36.62□□□□□ -1.357e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.357e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.377e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZKSCAN8-203ENST00000536028 1052 ntTSL 26.47□□□□□ -1.377e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.377e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.387e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KCTD20-208ENST00000483557 578 ntTSL 46.36□□□□□ -1.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NAT10-206ENST00000531723 528 ntTSL 56.35□□□□□ -1.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-207ENST00000434230 899 ntTSL 26.33□□□□□ -1.47e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.47e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.47e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CCT5-211ENST00000512975 578 ntTSL 46.28□□□□□ -1.47e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PLCG1-218ENST00000609821 570 ntTSL 56.27□□□□□ -1.411e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NUP58-204ENST00000394327 1408 ntTSL 56.22□□□□□ -1.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.431e-10■■■■■ 27.5
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