Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UTP4Q969X6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms