Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAMP4Q969E2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms