Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms