Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AVL9Q8NBF6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AVL9Q8NBF6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms