Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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CLDN19Q8N6F1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN19Q8N6F1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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