Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms