Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LMNTD2Q8IXW0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms