Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
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