Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC141Q6ZP82 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC141Q6ZP82 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms